基于流轉稅角度分析，增值稅作為流轉稅的第一大稅種對高新技術產業發展的影響體現在產業自身的發展、經營過程中。增值稅作為一種流轉稅具有稅負上的可轉嫁性，但因為現階段增值稅抵扣鏈條還存在缺陷因此存在留抵稅額同時受到商品需求價格彈性的限制，稅收負擔的轉嫁和歸宿不確定性較大，因此較高的增值稅稅負會削弱企業內部現金流水平并擠占研發創新支出。

從整體看，從營改增到增值稅稅率變動、增值稅改革，一定程度上有效減輕企業稅收負擔，降低企業生產投資成本，增加企業可利用現金流，有利于企業增加創新支出，進行研發創新活動，提高企業技術水平、生產率及市場競爭能力，具體體現在通過營改增和增值稅減稅并檔，打通增值稅抵扣鏈條，且不斷加碼升級；增值稅稅率下調，一定程度 *** 居民消費需求使產量增加。

提高高新技術產業營業收入，進而提升企業現金創造能力，增加創新投入和創新產出。企業所得稅作為我國所得稅類核心稅種之一，只有在企業一個會計年度后存在盈利水平才會征收，所得稅征收會擠占企業原本創新支出與相應的“風險準備金”，降低企業收入在扣除成本、費用、損失、不征稅收入、免稅收入、以前年度虧損后的利潤總額。

高新技術產業進行研發創新項目，若預期凈現值大于零則對其征收所得稅后的凈現值仍然大于零，具有繼續開發的價值；若預期凈現值小于零則不對其征收企業所得稅。所得稅的相關稅收優惠措施可以減輕高新技術產業的稅收負擔，直接增加企業當期經營活動現金凈流量，相應的提高企業創新投入，同時形成規模效率，提高創新產出。  

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